Isabel Guerrero Legarreta
Fabio Napolitano
José Ángel Pérez-Álvarez
Marcelo R. Rosmini
Marcelo Daniel Ghezzi
Aldo Bertoni
Juana Fernández-López
Manuel Viuda-Martos
Daniel Mota-Rojas
INTRODUCCIÓN
El búfalo de agua (Bubalus bubalis) ocupa una posición estratégica en la transición hacia sistemas pecuarios más eficientes, resilientes y ambientalmente responsables, particularmente en regiones tropicales y subtropicales donde su capacidad de adaptación a dietas fibrosas, condiciones climáticas adversas y esquemas productivos de pequeña y mediana escala le confiere ventajas comparativas relevantes. Sin embargo, el desarrollo científico en la especie ha sido históricamente asimétrico respecto al bovino tradicional Bos, con brechas en infraestructura genómica, bases de datos fenotípicas estandarizadas y esquemas de selección estructurados.
En la última década, esta situación ha comenzado a cambiar de manera sustantiva, dando paso a una expansión acelerada de estudios basados en tecnologías ómicas y enfoques de biología de sistemas. El presente artículo analiza críticamente nueve contribuciones recientes que, en conjunto, reflejan las principales fronteras científicas en la investigación bubalina contemporánea: genómica estructural y funcional, estudios de asociación a nivel del genoma completo, transcriptómica aplicada a rasgos productivos, proteómica reproductiva, caracterización de diversidad genética poblacional, microbioma ruminal comparado, sostenibilidad ambiental y epidemiología molecular de agentes transmitidos por vectores. Más que una revisión descriptiva de resultados individuales, este trabajo propone una lectura integradora orientada a identificar convergencias conceptuales, limitaciones metodológicas recurrentes y oportunidades estratégicas para el fortalecimiento del sector.
En el eje genómico, la evidencia acumulada apunta a una transición desde aproximaciones centradas en marcadores aislados hacia análisis más complejos que consideran arquitectura genética, variación estructural y redes de regulación. Esta evolución metodológica no solo amplía la comprensión de rasgos como producción láctea y fertilidad, sino que también expone desafíos persistentes, como tamaños muestrales reducidos, necesidad de validaciones funcionales y limitada integración con fenotipos de alta calidad. Paralelamente, los estudios transcriptómicos y proteómicos comienzan a delinear marcos mecanísticos que vinculan señalización celular, metabolismo energético e inmunomodulación con desempeño productivo, sugiriendo que la mejora genética del búfalo de agua requerirá una aproximación multicapas que trascienda la genotipificación tradicional. En el ámbito del microbioma ruminal y la sostenibilidad, la literatura reciente posiciona al búfalo de agua como modelo comparativo clave frente a otros rumiantes domésticos.
Las diferencias en composición microbiana y eficiencia fermentativa abren la discusión sobre intensidad de emisiones entéricas, uso del nitrógeno y aprovechamiento de recursos fibrosos, aspectos centrales en el debate global sobre cambio climático y producción animal. Estas evidencias obligan a replantear la narrativa del búfalo no solo como especie adaptada, sino como potencial referente en estrategias de mitigación ambiental. Asimismo, la dimensión sanitaria y epidemiológica, integrada mediante herramientas moleculares, evidencia la necesidad de abordar la productividad bubalina desde una perspectiva ecosistémica donde hospedero, patógeno y ambiente interactúan dinámicamente. La sostenibilidad productiva no puede desligarse de la vigilancia de agentes transmitidos por vectores ni de la comprensión de posibles mecanismos de resistencia o tolerancia propios de la especie.
En conjunto, los nueve estudios analizados permiten visualizar una etapa de maduración científica en la investigación del búfalo de agua, caracterizada por la incorporación de tecnologías de alto rendimiento y por una creciente convergencia entre genética, fisiología, microbiología y ciencias ambientales.
Este artículo propone examinar estas contribuciones bajo un marco analítico común, con el objetivo de identificar tendencias emergentes, vacíos críticos de conocimiento y líneas prioritarias para investigación futura, consolidando así una agenda científica coherente para el desarrollo sostenible del sector bubalino.
1) Análisis a nivel del genoma completo de variaciones en el número de copias revela genes candidatos asociados con rasgos de producción de leche en búfalo de agua (Bubalus bubalis)
En el artículo de Deng et al. (2024), https://doi. org/10.3168/jds.2023-24614, publicado en Journal of Dairy Science (Elsevier), los autores tuvieron como objetivo identificar variaciones en el número de copias (CNV, copy number variations) a nivel del genoma completo y evaluar su asociación con rasgos de producción láctea en búfalos de agua. El estudio parte de la premisa de que, aunque los polimorfismos de nucleótido único (SNP) han sido ampliamente estudiados en bovinos, las CNV representan una fuente importante de variación genética que podría explicar diferencias fenotípicas en producción de leche en búfalos.
El estudio se desarrolló utilizando datos de secuenciación genómica de individuos pertenecientes a poblaciones de búfalo lechero, sobre los cuales se detectaron regiones del genoma con variación en el número de copias. Los autores emplearon herramientas bioinformáticas específicas para identificar y filtrar CNV de alta calidad, y posteriormente realizaron análisis de asociación entre dichas variaciones estructurales y rasgos productivos medidos en los animales.
En total, el estudio identificó miles de eventos de CNV distribuidos a lo largo del genoma, agrupados en regiones denominadas CNVR (copy number variation regions). Tras el filtrado por frecuencia y calidad, los autores identificaron regiones significativamente asociadas con producción de leche y otros parámetros lácteos, incluyendo genes implicados en regulación metabólica, secreción láctea y desarrollo de la glándula mamaria. Entre los genes candidatos destacados en las regiones asociadas, el artículo menciona genes involucrados en procesos de metabolismo lipídico, señalización endocrina y regulación de la expresión génica en tejido mamario. Los análisis funcionales (enriquecimiento GO y rutas KEGG) mostraron sobre-representación de categorías relacionadas con procesos metabólicos y regulación biológica, lo que respalda la plausibilidad funcional de las asociaciones detectadas.
Los autores concluyen que las CNV constituyen una fuente relevante de variación genética en búfalos lecheros y que las regiones identificadas podrían servir como base para estudios futuros de selección asistida por marcadores. El trabajo aporta evidencia estructural del genoma bubalino asociada a producción láctea, ampliando el marco genético más allá de SNP tradicionales y fortaleciendo la base molecular del mejoramiento genético en la especie.
2) Detección molecular de agentes transmitidos por vectores en búfalos de agua (Bubalus bubalis) y ectoparásitos asociados en Brasil
En el artículo de Secato et al. (2025), https://doi. org/10.1007/s11250-025-04499-0, publicado en Tropical Animal Health and Production (Springer), los autores se plantearon como objetivo investigar la presencia molecular de agentes transmitidos por vectores -incluyendo piroplasmidos y agentes bacterianos de las familias Anaplasmataceae y Coxiellaceae- en búfalos de agua (Bubalus bubalis) y en ectoparásitos asociados (garrapatas y piojos) recolectados en el sudeste de Brasil. Este objetivo surge de la necesidad de comprender mejor la epidemiología de patógenos compartidos entre ganado bovino (Bos) y búfalos de agua, dado que ambos suelen cohabitar áreas de pastoreo en muchas regiones productivas.
El estudio incluyó 81 búfalos de agua, 165 garrapatas Rhipicephalus microplus y 92 piojos Haematopinus tuberculatus recolectados en el municipio de Passos, estado de Minas Gerais, Brasil. Se extrajo ADN de muestras de sangre y de cada ectoparásito para su análisis mediante reacción en cadena de la polimerasa convencional (cPCR) y pruebas específicas como qPCR y nPCR dirigidas a genes diana de diversos agentes: IS1111 de Coxiella burnetii, dsb de Ehrlichia spp., 18S rRNA de piroplasmidos, sbp-2 de Babesia bovis y rap-1α de Babesia bigemina. Los resultados revelaron que todas las muestras de sangre de búfalos y de ectoparásitos fueron positivas para genes endógenos de control, lo que confirmó la calidad del ADN extraído. Sin embargo, no se detectó presencia de Coxiella burnetii mediante qPCR ni de Babesia bigemina mediante nPCR específica.
En relación con otros agentes transmitidos por vectores, la presencia de Ehrlichia spp. se detectó en 6 de 257 ectoparásitos (2,3%) (incluyendo cinco garrapatas y un piojo). El análisis por BLASTn de las secuencias amplificadas mostró identidad entre 88,04% y 100% con Ehrlichia minasensis, un agente bacteriano previamente documentado en vectores de rumiantes. Asimismo, la prueba nPCR dirigida al gen 18S rRNA de piroplasmidos fue positiva en 8 de 81 búfalos (9,9%) y en 1 de 165 garrapatas (0,7%). El análisis de secuencias reveló > 99,9% de identidad con Babesia bovis y Babesia bigemina, aunque el ensayo específico de B. bovis (sbp-2) solo identificó un búfalo positivo (1,2%). Los autores interpretan que este estudio constituye la primera evidencia molecular documentada de la ocurrencia y de la posible coinfección de hemoparásitos transmitidos por garrapatas en búfalos de agua y ectoparásitos asociados en el sudeste de Brasil. La ausencia de detecciones significativas de Coxiella burnetii y la baja frecuencia de Babesia spp. entre los búfalos muestreados podrían estar relacionadas con una resistencia relativa de Bubalus bubalis frente a garrapatas R. microplus y a los patógenos que transmiten, una hipótesis respaldada por observaciones epidemiológicas previas en la especie.
Este estudio aporta evidencia epidemiológica molecular sobre la presencia de agentes transmitidos por vectores en búfalos de agua y en sus ectoparásitos, subrayando la necesidad de ampliar la vigilancia de estos patógenos en sistemas de producción integrados y de evaluar su impacto potencial sobre la salud y productividad de hatos bubalinos.
3) Microbioma ruminal alterado en búfalos de agua reduce las emisiones entéricas de metano y nitrógeno
En el artículo de Paul et al. (2026), https://doi. org/10.1016/j.jenvman.2025.128347, publicado en Journal of Environmental Management (Elsevier), los autores tuvieron como objetivo evaluar cómo la composición del microbioma ruminal en búfalos de agua (Bubalus bubalis) se relaciona con la producción de metano (CH4) y las pérdidas de nitrógeno, en comparación con otras especies rumiantes. El estudio parte de la hipótesis de que el búfalo de agua posee características microbianas ruminales particulares que podrían explicar diferencias en eficiencia fermentativa y emisiones entéricas.
El trabajo se desarrolló mediante análisis metagenómico del contenido ruminal, empleando secuenciación de alto rendimiento para caracterizar la comunidad microbiana y cuantificar la abundancia relativa de bacterias metanogénicas y otros microorganismos funcionales implicados en la fermentación de carbohidratos estructurales. Paralelamente, se midieron emisiones entéricas de metano y parámetros relacionados con la utilización del nitrógeno dietario. Los resultados mostraron diferencias significativas en la estructura del microbioma ruminal de búfalos, destacándose una composición microbiana asociada con mayor eficiencia en la degradación de fibra y una menor proporción relativa de arqueas metanogénicas en comparación con reportes típicos en bovinos Bos. El estudio documenta una reducción en la producción de metano entérico por unidad de materia seca ingerida, lo que sugiere una mayor eficiencia energética del sistema ruminal bubalino.
Asimismo, se observaron patrones de utilización de nitrógeno que indicaron menor excreción relativa, lo cual tiene implicaciones ambientales relevantes. Los análisis funcionales identificaron rutas metabólicas enriquecidas vinculadas con fermentación acetogénica y utilización eficiente de sustratos fibrosos, apoyando la hipótesis de que la configuración microbiana del búfalo de agua contribuye a una menor intensidad de emisiones. Los autores discuten que estas diferencias podrían estar asociadas tanto a factores genéticos de la especie como a adaptaciones evolutivas a dietas fibrosas en ambientes tropicales.
En sus conclusiones, Paul et al. sostienen que el microbioma ruminal del búfalo de agua presenta características distintivas que pueden traducirse en menor producción de metano y mejor eficiencia en el uso del nitrógeno, posicionando a la especie como potencialmente más favorable desde una perspectiva ambiental en comparación con otros rumiantes domésticos. El estudio aporta evidencia funcional que vincula ecología microbiana con sostenibilidad productiva, fortaleciendo el eje de microbioma y mitigación ambiental.
4) Oportunidades y desafíos para mejorar el búfalo de pantano (Bubalus bubalis carabanensis): perspectivas genéticas y genómicas
En el artículo de Pineda et al. (2021), https://doi. org/10.3389/fgene.2021.629861, publicado en Frontiers in Genetics, los autores tuvieron como objetivo analizar el estado actual del conocimiento genético y genómico del búfalo de pantano (Swamp buffalo), identificando oportunidades y desafíos para su mejoramiento productivo y conservación.
El estudio parte del reconocimiento de que el búfalo de pantano, ampliamente distribuido en el sudeste asiático, ha sido históricamente menos estudiado que el búfalo de río, pese a su importancia socioeconómica en sistemas de pequeña escala. El trabajo corresponde a una revisión que integra información sobre caracterización genética, diversidad poblacional, herramientas genómicas disponibles y aplicaciones en selección. Los autores describen que el búfalo de pantano posee 48 cromosomas, en contraste con los 50 cromosomas del búfalo de río, diferencia que deriva de una fusión cromosómica Robertsoniana. Esta particularidad citogenética tiene implicaciones para la hibridación entre ambos tipos y para los programas de mejoramiento.
La revisión detalla que los avances recientes en secuenciación del genoma completo y el desarrollo de paneles de SNP han permitido una caracterización más precisa de la diversidad genética en poblaciones de búfalo de pantano. Se discute que estudios de estructura poblacional han identificado diferenciación genética entre poblaciones regionales, lo que refleja tanto historia evolutiva como patrones de manejo humano. Los autores subrayan que la diversidad genética constituye un recurso estratégico para programas de mejoramiento y conservación. Asimismo, el artículo aborda limitaciones importantes, incluyendo la disponibilidad restringida de datos fenotípicos estandarizados y la escasa implementación de esquemas de selección estructurados en muchas regiones donde predomina el búfalo de pantano. Se enfatiza que la integración de herramientas genómicas con registros productivos confiables es esencial para avanzar hacia selección genómica efectiva.
En sus conclusiones, Pineda et al. sostienen que el búfalo de pantano presenta un potencial significativo para el mejoramiento productivo, pero requiere inversiones en infraestructura genética, generación de bases de datos fenotípicas y fortalecimiento de programas de conservación. El artículo establece un marco conceptual claro para vincular diversidad genética, recursos genómicos y sostenibilidad productiva en poblaciones bubalinas tradicionales.
5) Una nueva perspectiva en la identificación de marcadores SNP potenciales para la caracterización genómica de razas de búfalo en Pakistán
En el artículo de Anas et al. (2023), https://doi. org/10.3390/ani13152543, publicado en Animals (MDPI), los autores tuvieron como objetivo identificar y caracterizar polimorfismos de nucleótido único (SNP) con potencial utilidad para la diferenciación genética y la caracterización genómica de razas de búfalo en Pakistán. El estudio se fundamenta en la necesidad de fortalecer los programas de mejoramiento y conservación genética en poblaciones bubalinas donde los registros fenotípicos estructurados son limitados y la selección tradicional ha sido predominantemente empírica.
El estudio se desarrolló mediante análisis de datos genómicos obtenidos de diferentes razas de búfalo paquistaní, utilizando herramientas de genotipificación de alta densidad. Los autores aplicaron filtros de calidad estándar para excluir SNP con baja frecuencia alélica menor (MAF), alta tasa de datos faltantes o desviaciones significativas del equilibrio de Hardy-Weinberg. Tras el proceso de depuración, se conservaron miles de marcadores polimórficos de alta calidad distribuidos a lo largo del genoma, los cuales fueron utilizados para análisis de diversidad genética, estructura poblacional y diferenciación entre razas. Los resultados mostraron niveles diferenciados de heterocigosidad observada y esperada entre las razas analizadas, lo que indica variabilidad genética significativa dentro de la población bubalina estudiada.
Los análisis de estructura poblacional (incluyendo métodos basados en componentes principales y modelos de agrupamiento) evidenciaron separación genética clara entre determinadas razas, mientras que otras mostraron mayor proximidad genética, reflejando posibles intercambios históricos de germoplasma o presiones de selección similares. El estudio identificó además SNP candidatos ubicados en regiones genómicas asociadas con genes relacionados con rasgos productivos, crecimiento y función metabólica, lo que sugiere su potencial aplicación futura en esquemas de selección asistida por marcadores. Los autores enfatizan que la caracterización genómica detallada constituye una herramienta esencial para evitar la erosión genética y optimizar el aprovechamiento de la variabilidad disponible.
En sus conclusiones, Anas et al. sostienen que la identificación de SNP informativos y la evaluación de la estructura genética poblacional proporcionan una base sólida para el diseño de programas de mejoramiento genético más precisos en búfalos. El estudio fortalece el marco genómico del sector bubalino al aportar herramientas concretas para la diferenciación racial, la conservación de diversidad genética y la implementación progresiva de selección basada en información molecular.
6) Identificación de candidatos proteicos en espermatozoides de búfalo de agua (Bubalus bubalis) mediante análisis proteómico comparativo
En el artículo de Karanwal et al. (2023), https://doi. org/10.3389/fcell.2023.1119220, publicado en Frontiers in Cell and Developmental Biology, los autores tuvieron como objetivo identificar proteínas diferencialmente expresadas en espermatozoides de búfalo de agua asociadas con la calidad seminal, utilizando un enfoque proteómico comparativo. El estudio parte del reconocimiento de que la fertilidad masculina constituye un componente crítico en programas de inseminación artificial y mejoramiento genético, y que la caracterización molecular del espermatozoide bubalino es aún limitada en comparación con el bovino tradicional Bos.
El trabajo se desarrolló empleando análisis proteómico basado en espectrometría de masas para comparar perfiles proteicos entre muestras seminales clasificadas según parámetros de calidad espermática. Los autores evaluaron variables clásicas como motilidad, viabilidad y morfología espermática, y posteriormente analizaron las diferencias en la abundancia relativa de proteínas entre grupos de alto y bajo desempeño seminal. El análisis permitió identificar múltiples proteínas diferencialmente expresadas entre los grupos comparados. Entre las proteínas destacadas se incluyeron aquellas relacionadas con metabolismo energético mitocondrial, estructura del citoesqueleto flagelar, regulación del estrés oxidativo y procesos de capacitación espermática.
Los autores reportan que varias de estas proteínas mostraron diferencias estadísticamente significativas en abundancia relativa entre los grupos de alta y baja calidad seminal, lo que sugiere su posible papel como biomarcadores moleculares de fertilidad en búfalos de agua. Además, los análisis funcionales indicaron enriquecimiento de rutas asociadas con producción de ATP, transporte intracelular y regulación redox, procesos esenciales para la motilidad y la integridad funcional del espermatozoide. El estudio también discute la relevancia de estas proteínas en la estabilidad estructural del flagelo y en la interacción espermatozoide-ovocito. En sus conclusiones, Karanwal et al. sostienen que el perfil proteómico diferencial identificado proporciona información valiosa sobre los mecanismos moleculares que subyacen a la fertilidad masculina en búfalos de agua. Los autores destacan que estos hallazgos podrían contribuir al desarrollo futuro de herramientas diagnósticas para evaluar calidad seminal y optimizar programas de inseminación artificial en la especie bubalina.
7) Identificación de MAPK10 como gen candidato para alta producción de leche en búfalos de agua mediante un estudio de asociación del genoma completo
En el artículo de Li et al. (2025), https://doi.org/10.3390/ ani15172567, publicado en Animals (MDPI), los autores tuvieron como objetivo identificar marcadores genéticos asociados con alta producción de leche en búfalos de agua (Bubalus bubalis) mediante un enfoque de estudio de asociación del genoma completo (GWAS, genome-wide association study) aplicado a la producción de leche estandarizada a 305 días (305-day milk yield). Para ello integraron datos genómicos y fenotípicos de 78 búfalas, incluyendo Murrah (n = 21), Nili-Ravi (n = 21) y cruzas Murrah × Nili-Ravi (n = 36), todas con registros completos de lactación y entre 2 y 5 lactancias. En cuanto al diseño analítico, los autores reportan que emplearon tres enfoques GWAS (cBLUP, GMATs y BayesR), con criterios de control de significancia que incluyeron correcciones como FDR < 0.05.
En la descripción de la población, presentan un dato clave para contextualizar el fenotipo: la producción promedio a 305 días fue de 2321.3 kg, y aproximadamente 15% de los individuos fueron clasificados como altas productoras al superar 3000 kg de leche en 305 días. El resultado central del estudio es la identificación de dos SNP significativos asociados con rasgos de producción de leche, a partir de los cuales los autores definieron regiones genómicas circundantes y reportaron cuatro genes candidatos: MAPK10, ZNF84, ZNF26 y ZNF605. De manera explícita, el artículo enfatiza a MAPK10 (mitogen-activated protein kinase 10) como el candidato más consistente, señalando su conexión con rutas relacionadas con lactación.
En la anotación funcional, los autores reportan enriquecimiento en vías vinculadas con lactación y señalización, incluyendo la vía de señalización de prolactina (prolactin signaling pathway) asociada con MAPK10, así como rutas como MAPK signaling pathway, adipocytokine signaling pathway e IL-17 signaling pathway, donde MAPK10 aparece como elemento relevante en su análisis. En la interpretación, los autores proponen que la señal detectada en MAPK10 puede actuar como un marcador molecular candidato para rasgos de alta producción, aunque también reconocen con claridad la principal limitación metodológica: el tamaño muestral (n = 78) restringe la robustez inferencial y convierte los hallazgos en una base preliminar que requiere validación en cohortes mayores y con aproximaciones funcionales complementarias (por ejemplo, transcriptómica).
8) Microbiota ruminal en bovinos y búfalos: aportes sobre diversidad bacteriana específica del hospedero
En el artículo de Paul et al. (2025), https://doi.org/10.3390/ biology14091166, publicado en Biology (MDPI), los autores tuvieron como objetivo construir una comparación global, a gran escala, de la diversidad bacteriana del rumen entre bovinos y búfalos de agua (Bubalus bubalis), partiendo de una limitación recurrente en la literatura: muchos estudios comparativos previos se basan en pocos animales y una sola región o dieta, lo que restringe la cobertura real de la diversidad microbiana.
Para resolverlo, plantean un enfoque de meta-análisis utilizando secuencias 16S rRNA ya depositadas en GenBank, con el propósito de estimar de manera más amplia el “censo” bacteriano ruminal de ambas especies y detectar patrones consistentes de diferenciación interespecífica. En su metodología, los autores analizaron 14,913 secuencias del gen 16S rRNA (rrn) obtenidas por secuenciación Sanger y disponibles públicamente, de las cuales 13,432 correspondieron a bovinos y 1,481 a búfalos. A partir de esa base, reportan que las secuencias de origen bovino representaron 18 filos y 165 géneros, mientras que las de búfalo representaron 12 filos y 67 géneros, lo que ya sugiere diferencias marcadas en riqueza taxonómica bajo el mismo marco de análisis. Los resultados cuantitativos del resumen precisan además la estructura relativa de los filos dominantes. En bovinos, Firmicutes fue el filo dominante con 47.9% de todas las secuencias, seguido por Bacteroidetes (32.3%) y Proteobacteria (8.6%).
En búfalos, Firmicutes también fue el filo dominante con 47.2%, pero la distribución posterior se reorganiza: Bacteroidetes representó 38.3% y Proteobacteria 4.6%, evidenciando un cambio notable en la contribución relativa de estos grupos entre especies. Un aporte especialmente útil para una revisión moderna es que los autores cuantifican qué parte de la diversidad es compartida y cuál parece ser propia de cada hospedero. Identificaron 172 unidades taxonómicas operativas (OTU) no raras compartidas entre bovinos y búfalos; adicionalmente, reportaron 17 OTU únicas de búfalo, pertenecientes a tres filos: Bacteroidetes, Firmicutes y Fibrobacteres. En contraste, describen en bovinos 774 OTU únicas, asignadas a seis filos, con distribución numérica explícita: Firmicutes (422 OTU), Bacteroidetes (234), Fibrobacteres (99), Actinobacteria (7), Cyanobacteria (5) y SR1 (7).
Estas cifras, por sí solas, sustentan la idea de que la diversidad bacteriana ruminal difiere de manera importante entre especies y que no puede asumirse equivalencia taxonómica aun cuando compartan nicho fermentativo. En la lectura integradora que proponen, los autores señalan además géneros predominantes diferenciales: en bovinos destacan Butyrivibrio, Prevotella, Psychrobacter y Fibrobacter, mientras que en búfalos resaltan Succiniclasticum, Prevotella, Rumenobacter y Fibrobacter, lo cual refuerza la noción de que el “perfil funcional” del rumen puede estar influido por especificidad del hospedero y, por extensión, abrir la puerta a estrategias de nutrición y manejo más ajustadas por especie. En conclusión, Paul et al. sostienen que las diferencias cuantificadas en riqueza y composición respaldan el desarrollo de estrategias específicas para mejorar la utilización de dietas fibrosas, particularmente relevantes en producción bubalina.
9) Análisis transcriptómico de sangre total de búfalas Murrah lactantes divergentes por méritos genéticos contrastantes para rendimiento de leche
En el artículo de Sikka et al. (2023), https://doi. org/10.3389/fanim.2023.1135429, publicado en Frontiers in Animal Science, los autores tuvieron como objetivo perfilar funcionalmente, a nivel transcriptómico, el rasgo “volumen de leche” en búfalas Murrah (Bubalus bubalis) mediante el análisis del transcriptoma de sangre total, comparando animales con alta versus baja producción, pero bajo un criterio clave: las búfalas seleccionadas representaban la proyección del mérito genético heredado como hijas de toros extremos (muy altos y muy bajos) clasificados por valor genético estimado (EBV, estimated breeding value) dentro de un esquema de prueba de progenie con más de 150 toros evaluados. En términos fenotípicos, el contraste productivo queda claramente cuantificado: el promedio de producción estándar a 305 días (promedio de varias paridades) fue de 2909.50 ± 492.63 L para las de alto mérito y 1869.57 ± 189.36 L para las de bajo mérito genético, lo que establece una diferencia amplia y biológicamente relevante entre grupos.
El enfoque metodológico se basó en construir y comparar ensamblajes transcriptómicos a partir de datos RNA-seq de búfalas multíparas (paridad 5–6) de alto y bajo desempeño, y contrastarlos con un ensamblaje de referencia construido a partir de bibliotecas transcriptómicas de búfalas seleccionadas en diferentes estados fisiológicos (n = 16 en el ensamblaje de referencia, según reportan los autores). Al mapear las lecturas sobre el genoma del búfalo mediterráneo, los autores reportan que el análisis con Cufflinks permitió determinar más de 25,000 genes, y que la comparación alta vs baja producción identificó genes diferencialmente expresados visualizados mediante mapas de calor y gráficos tipo volcán. Los resultados cuantitativos del estudio, tal como aparecen en el resumen, señalan que los genes diferencialmente expresados significativos cumplieron p < 0.05 y FDR < 0.05, e incluyeron 83 genes con regulación a la baja (downregulating) y 142 genes con regulación al alza (up-regulating) en el contraste entre categorías de mérito genético.
Desde la interpretación funcional, los autores describen que estos genes se agrupan en procesos biológicos que articulan una red fina de regulación, destacando señalización celular, proliferación y diferenciación celular, empalme de ARN (RNA splicing), metabolismo de grasa e incluso generación de respuesta a agentes infecciosos, modulados por factores de transcripción y proteínas de unión. En cuanto a rutas biológicas, el artículo subraya explícitamente tres ejes de señalización como emergentes en la explicación molecular del rendimiento lácteo: TNF-α, NF-κB (factor nuclear kappa B) y la cascada MAPK/PI3K-AKT, interpretadas como nodos que integran el ajuste fino de procesos metabólicos y celulares que convergen en la producción de leche en búfalos.
En conjunto, Sikka et al. concluyen que el transcriptoma de sangre total, aplicado a animales genéticamente contrastantes, permite recuperar patrones de expresión y redes de interacción proteína- proteína vinculadas con lactación, y proponen este enfoque como una vía no invasiva útil para apoyar estrategias de mejoramiento orientadas a expresión deseable del rasgo de producción de leche en Murrah.
CONCLUSIÓN
El análisis integrado de estas nueve contribuciones científicas confirma que la investigación en Bubalus bubalis ha entrado en una fase de consolidación estructural, caracterizada por la adopción progresiva de enfoques ómicos, herramientas bioinformáticas avanzadas y marcos conceptuales propios de la biología de sistemas. Este tránsito metodológico no solo amplía la comprensión de la arquitectura genética y funcional de rasgos productivos y reproductivos, sino que también redefine el posicionamiento estratégico del búfalo dentro de los debates contemporáneos sobre eficiencia biológica y sostenibilidad ambiental. En el plano genético y genómico, la convergencia entre estudios de variación estructural, asociación genómica, transcriptómica y proteómica sugiere que la mejora bubalina futura dependerá menos de marcadores aislados y más de la integración multicapas de información molecular.
Sin embargo, persisten limitaciones críticas: tamaños muestrales restringidos, necesidad de validación funcional, escasez de bases fenotípicas robustas y heterogeneidad en los esquemas de registro productivo. Superar estas brechas requerirá inversiones coordinadas en infraestructura de datos, estandarización fenotípica y consorcios internacionales que permitan escalar la potencia estadística y la reproducibilidad de los hallazgos. En paralelo, la evidencia relacionada con microbioma ruminal y eficiencia fermentativa proyecta al búfalo como un modelo biológico relevante en la transición hacia sistemas pecuarios de menor intensidad de emisiones. La articulación entre genética del hospedero y ecología microbiana emerge como un eje prioritario para comprender cómo la especie puede optimizar el aprovechamiento de recursos fibrosos manteniendo una huella ambiental relativamente contenida.
Esta intersección entre productividad y mitigación climática representa uno de los campos más prometedores para investigación aplicada. La dimensión sanitaria y la caracterización de diversidad genética poblacional, por su parte, recuerdan que la sostenibilidad no es exclusivamente productiva ni ambiental, sino también epidemiológica y conservacionista. La preservación de variabilidad genética y la vigilancia molecular de patógenos constituyen componentes esenciales para evitar erosión genética y pérdidas de resiliencia biológica en sistemas intensificados. En conjunto, la evidencia revisada permite afirmar que el búfalo de agua ya no debe considerarse una especie secundaria en la agenda científica global, sino un actor estratégico cuya biología ofrece oportunidades singulares para integrar genética avanzada, eficiencia nutricional, calidad de productos y sostenibilidad.
El desafío inmediato consiste en transformar el conocimiento generado en plataformas de innovación reproducibles y escalables, capaces de impactar de manera tangible la productividad, la rentabilidad y la resiliencia de los sistemas bubalinos en Latinoamérica y otras regiones clave del mundo.
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https:// bmeditores.mx /ganaderia/descargas /el-bufalo- de-agua- en-las- americas- comportamiento- y-productividad-5ta-edicion
Artículo publicado en “Entorno Ganadero Febrero Marzo 2026“
